硅藻土化學成份主要是SiO2,并含有少量Fe2O3、CaO、MgO、Al2O3、K2O、Na2O、P2O5及有機雜質。SiO2通常占80%以上,高可達94%。硅藻土的氧化鐵含量一般為1~1.5%,氧化鋁含量為3~6%。
硅藻土通常呈淺黃色或淺灰色,質軟,多孔而輕,吸水性和滲透性強。工業上常用來作為保溫材料、過濾材料、填料、研磨材料、水玻璃原料、脫色劑及催化劑載體等。顯微鏡下可觀察到天然硅藻土的特殊多孔性構造,這種微孔結構是硅藻土具有特征理化性質的原因。
天然硅藻土的主要成分是SiO2,者色白,SiO2含量常超過70%。單體硅藻無色透明,硅藻土的顏色取決于粘土礦物及有機質等,不同礦源硅藻上的成分不同.